Дачная амнистия» позволяет зарегистрировать построенный дом немного быстрее и проще, но только в том случае, если дом не нарушает никаких градостроительных норм и правил

Различие между уведомительным порядком и «дачной амнистией» в соблюдении отступов от границ земельного участка. То есть на "дачную амнистию" не всегда можно рассчитывать, так как по ней не получится оформить дом, построенный с нарушениями правил землепользования и застройки или находящийся в какой-либо охранной зоне с нарушением. 

Если при строительстве нарушены градостроительные нормы или правила землепользования и застройки, участок попадает в охранную зону, где строительство запрещено, то построенный дом могут никогда не оформить, а в самом негативном случае - могут еще и потребовать снести за свой счет. Гарантией от такого исхода может быть полученное в администрации «Уведомление о соответствии планируемого строительства» и «Уведомление о соответствии законченного строительства».

Узнать параметры, установленные правилами землепользования и застройки при строительстве жилого дома, сведения о наличии или отсутствии охранных зон на участке, можно заказав выписку из ЕГРН.

На сегодняшний день одновременно работают две процедуры регистрации на жилой или садовый дом, созданный на земельном участке, предназначенном для ведения гражданами садоводства, для индивидуального жилищного строительства или для ведения личного подсобного хозяйства 

Вы можете сами  выбирать, по какой процедуре регистрировать свой построенный дом.